coriell的*設(shè)備和專業(yè)知識(shí)詳細(xì)介紹

發(fā)布時(shí)間： 2023-03-22　　點(diǎn)擊次數(shù)： 970次

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概述科里埃爾研究所致力于推進(jìn)研究，為教師、學(xué)生和合作者提供支持基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究的*設(shè)備和專業(yè)知識(shí)。為此，我們的研究核心設(shè)施在廣泛的科學(xué)領(lǐng)域提供各種各樣的服務(wù); 這些不同的資源提供儀器，技術(shù)專業(yè)知識(shí)，培訓(xùn)和教育那些參與追求創(chuàng)新，端研究。這些設(shè)施擴(kuò)大了調(diào)查人員的能力，促進(jìn)了合作，加快了發(fā)現(xiàn)和翻譯的速度。

生物信息學(xué)可用的分析工作流程: RNA-seqChIP-seqATAC-seqWES/WGE 減少表示亞硫酸鹽定序(RRBS)微生物組宏基因組學(xué)(16S 測(cè)序) scRNA-seqscATAC-seqexample 標(biāo)準(zhǔn)輸出: 用于在 UCSC 或 IGV 上追蹤可視化的 RNA-seqC 報(bào)告文件(bigwig) ;BAM 比對(duì)文件可用于 requestRaw 基因計(jì)數(shù)表列出差異表達(dá)基因及其表達(dá)倍數(shù)變化和 FDR 校正的 p 值3可視化: PCA，熱圖，路徑的火山圖列表 RRBSQC reportBAM 比對(duì)文件(當(dāng)請(qǐng)求時(shí))所有檢測(cè)到的 CpG 位點(diǎn)的完整甲基化表具有 p 值(FDR 校正)的差異甲基化 CpG 位點(diǎn)的列表可視化: PCA 圖，熱圖,對(duì)于顯著甲基化的 CpGs 列表附近 genesscRNA-seqC 報(bào)告條形碼 BAM 比對(duì)文件可用(用于 GEO) UMI/Cell count tabletSNE 或 UMAP 聚類用于亞群列表差異表達(dá)基因列表及其表達(dá)倍數(shù)變化和 FDR 校正的 p 值基于聚類或?qū)嶒?yàn)條件(兩者均為額外的2小時(shí)收費(fèi))。如果沒(méi)有基于聚類的亞群確定，差異表達(dá)將基于實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行。2可視化: 熱圖，火山圖路徑列表費(fèi)用: 生物信息學(xué)分析起價(jià)每小時(shí)250美元。批量分析每個(gè)樣品的估計(jì)費(fèi)用

流式細(xì)胞術(shù)和細(xì)胞分選 Coriell 流式細(xì)胞術(shù)設(shè)備能夠使用 BD FACSymphony (檢測(cè)最大16種顏色)和 SONY 分選細(xì)胞分選(無(wú)菌，速度高達(dá)20,000個(gè)細(xì)胞/秒)從基于多達(dá)6個(gè)熒光染料的均勻或混合細(xì)胞群體中進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析，其可以同時(shí)分選多達(dá)兩個(gè)單獨(dú)的群體，包括 BSL-2水平的人源樣品。設(shè)施工作人員支持研究人員創(chuàng)建高效、低成本的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)ーー即通過(guò)優(yōu)化特定于細(xì)胞計(jì)數(shù)的試劑和熒光染料的選擇ーー并在分析儀器的操作方面提供協(xié)助。我們的設(shè)施還為流式和成像細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)的分析提供技術(shù)支持，以便發(fā)表，介紹和納入贈(zèng)款申請(qǐng); 管理細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)(存儲(chǔ)，歸檔和檢索) ; 以及管理低成本獲取后分析軟件的現(xiàn)場(chǎng)許可證。

基因組學(xué)和表觀基因組學(xué)基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表觀基因組學(xué)服務(wù)針對(duì)基因分型和突變分析的深度測(cè)序針對(duì)單個(gè)等位基因的 DNA 甲基化分析的亞硫酸氫鹽擴(kuò)增子測(cè)序減少表征亞硫酸鹽定序(RRBS)用于全基因組分析的 DNA 甲基化16S 核糖體 DNA 測(cè)序用于微生物組分析 Bulk 和單細(xì)胞用于基因表達(dá)分析的 RNA-seq Bulk 和單細(xì)胞 ATAC-seq 用于染色質(zhì)可及性的全基因組分析用于 DNA 結(jié)合蛋白和組蛋白修飾的全基因組作圖的 ChIP-seqS2聚焦超聲波儀 Pyromark Q24焦磷酸測(cè)序平臺(tái) Applied Biosystems QuantStudio6 Flex 實(shí)時(shí) PCR 儀器安捷倫生物分析儀2100Qbit 熒光計(jì) NanoDrop 分光光度計(jì) Invitrogen iBright CL1000凝膠成像儀

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞科里爾的 iPSC 核心提供了多種服務(wù)，以滿足您的干細(xì)胞需求。Coriell 的 iPSC 實(shí)驗(yàn)室擁有建立 hiPSC 系列的廣泛專業(yè)知識(shí)，使用包括仙臺(tái)病毒和附加質(zhì)粒載體在內(nèi)的不同方法重編程各種“親本”細(xì)胞類型。Coriell 擁有一大批明顯健康和疾病模式的 iPSC 系列，而且這些系列的數(shù)量還在不斷增加。疾病特異性細(xì)胞系包括神經(jīng)系統(tǒng)疾病、單基因疾病和染色體異常。幾十年來(lái)，科里爾在幫助定義和實(shí)施生物樣本收集、加工(確保無(wú)菌性、完整性和真實(shí)性)、質(zhì)量保證(QA)、質(zhì)量控制(QC)、深低溫保存、樣本安全儲(chǔ)存、收集維護(hù)/庫(kù)存管理和分銷的最佳實(shí)踐方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。Coriell 公司的實(shí)驗(yàn)室按照 ISO9001標(biāo)準(zhǔn)的嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)操作程序運(yùn)作，細(xì)胞系資源經(jīng)過(guò)全面的細(xì)胞系完整性和質(zhì)量控制測(cè)試。就干細(xì)胞系而言，多能性和分化潛力的評(píng)估是使用各種技術(shù)平臺(tái)進(jìn)行的。在 Coriell 進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系 QC 檢測(cè)(作為對(duì)科學(xué)界的一項(xiàng)服務(wù))包括，但不限于: 生長(zhǎng)和生存能力評(píng)估微生物和真菌不育檢測(cè)支原體檢測(cè)人類病原體檢測(cè)身份檢測(cè)(微衛(wèi)星與親本細(xì)胞培養(yǎng)物匹配)細(xì)胞遺傳學(xué) G 帶核型微陣列基因分型確認(rèn)無(wú)整合重編程使用干細(xì)胞表面標(biāo)記通過(guò)免疫細(xì)胞化學(xué)和/或流式細(xì)胞術(shù)和堿性磷酸酶染色體體外胚胎體(EB)檢測(cè)和定量分析三系分化潛能使用 RT-PCR 分析胚層特異性基因的表達(dá)多能性和三系分化潛能使用 Applied Biosystems TaqMan hPSC Scorecard Panel。

動(dòng)物和異種移植科里爾動(dòng)物和異種移植核心提供了廣泛的服務(wù)，以協(xié)助異種移植動(dòng)物研究的設(shè)計(jì)和實(shí)施。Core 公司擁有一個(gè)大型的免疫缺陷(NSG)小鼠繁殖群(約30對(duì)) ，以滿足客戶的需求。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物被安置在我們 NSG 專用的 BSL-2空間，該空間全配備了手術(shù)和生存手術(shù)所必需的所有設(shè)備。該設(shè)施的能力包括方位的異種移植模型，包括移植到 NSG 小鼠中的人 CD34 + 細(xì)胞，血液惡性腫瘤(AML，ALL)的原位患者衍生的異種移植(PDX)模型和實(shí)體瘤(即肝，卵巢，腦，肺)模型。聯(lián)系連博士，

Coriell 的 Organoid Core 提供了多種3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型，以滿足研究人員的需要。3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型，如類器官和球體，更接近地概括了細(xì)胞結(jié)構(gòu)和細(xì)胞在體內(nèi)自然生長(zhǎng)的微環(huán)境。3D 模型的進(jìn)步為器官發(fā)生、疾病建模和藥物治療提供了寶貴的研究機(jī)會(huì)。憑借 Coriell 在多種細(xì)胞類型和疾病模型方面的長(zhǎng)期經(jīng)驗(yàn)，我們已經(jīng)優(yōu)化了許多方案，以適應(yīng)細(xì)胞系到細(xì)胞系和疾病模型的變化。高質(zhì)量的細(xì)胞培養(yǎng)模型和工具是三維細(xì)胞培養(yǎng)成功的關(guān)鍵。Coriell 的 Organoid Core 能夠?yàn)樗?span>3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型提供一致的可重復(fù)結(jié)果。

細(xì)胞成像科里爾細(xì)胞成像核心為新澤西州南部地區(qū)的研究人員提供了前沿光學(xué)成像能力。我們提供激光掃描和旋轉(zhuǎn)圓盤(pán)共聚焦顯微鏡，光片顯微鏡，超分辨率顯微鏡技術(shù)和寬視場(chǎng)顯微鏡用于固定和實(shí)時(shí)成像。我們的特色共聚焦顯微鏡是奧林巴斯 fv3000共聚焦顯微鏡，使廣泛的成像模式，包括宏觀顯微成像，超分辨率顯微鏡技術(shù)和定量數(shù)據(jù)分析。奧林巴斯 FV3000的其他關(guān)鍵特性是: TruSpectal 高靈敏度多通道成像系統(tǒng)使用專有的光譜檢測(cè)技術(shù)，FV3000共聚焦顯微鏡的 TruSpectal 探測(cè)器結(jié)合了高靈敏度和光譜靈活性，甚至可以檢測(cè)到最暗的熒光團(tuán)。與傳統(tǒng)的光譜探測(cè)技術(shù)相比，它的光傳輸能力提高了3倍。它還有獨(dú)立的可調(diào)通道，以優(yōu)化每個(gè)熒光團(tuán)的信號(hào)檢測(cè)。它的 lambda 掃描模式使得復(fù)雜的重疊熒光信號(hào)能夠精確的光譜分解。FV3000顯微鏡的宏觀到微觀的工作流程為數(shù)據(jù)采集提供了一個(gè)路線圖，使你能夠在上下文中看到數(shù)據(jù)，并輕松定位感興趣的區(qū)域以獲得更高分辨率的成像。它使用一個(gè)低放大率1.25 X 或2倍的物鏡來(lái)快速捕捉整個(gè)標(biāo)本的大視場(chǎng)(FOV)地圖。它可以識(shí)別覆蓋地圖上感興趣的區(qū)域，然后切換到一個(gè)更高的放大率目標(biāo)的高分辨率共焦成像到120納米奧林巴斯超分辨率技術(shù)(FV-OSR)。

FV3000RS 混合掃描單元使用振鏡掃描儀進(jìn)行精確掃描，同時(shí)使用共振掃描儀，非常適合對(duì)活體生理事件進(jìn)行高速成像。它可以使用共振掃描儀以大視場(chǎng)捕捉視頻速率圖像，其特點(diǎn)是使用剪輯掃描，速度從30幀率(fps)到最高438幀每秒(fps)。精確的時(shí)間延遲成像時(shí)間延遲實(shí)驗(yàn)需要一致的焦點(diǎn)和低光毒性的樣品。奧林巴斯的 TruFocus 設(shè)備有助于在活細(xì)胞成像過(guò)程中保持聚焦，盡管溫度發(fā)生變化或添加了試劑。FV3000顯微鏡的高靈敏度探測(cè)器需要的激光功率明顯減少，而共振掃描儀減少激光照明時(shí)間，降低光毒性，為更多的生理準(zhǔn)確的共焦成像數(shù)據(jù)。由于硅油的折射率接近于活體組織，因此硅油目標(biāo)可以在組織內(nèi)部以最小的球面像差進(jìn)行高分辨率的觀察。它的折射率匹配提供了一個(gè)理想的焦距體積，導(dǎo)致完的體積重建，并使大型生物體的高分辨率共焦成像。它的長(zhǎng)距離工作能夠在深度上進(jìn)行詳細(xì)的顯微成像。利用三維重建軟件，可以實(shí)時(shí)觀察數(shù)據(jù)的展開(kāi)情況，并且可以方便地觀察結(jié)構(gòu)。

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